バシラス界(Bacillati)

界 Kingdom	門 Phylum	綱 Class	目 Order
バシラス界 Bacillati バシラス界 Bacillati バシラス界 Bacillati	バシラス門[1] Bacillota	バシラス綱 Bacilli	バシラス目 Bacillales
		バシラス綱 Bacilli	ラクトバシラス目 Lactobacillales
		クロストリディウム綱 Clostridia	クロストリディウム目 Clostridiales
			ハロアナエロビウム目 Halanaerobiales
			テルモアナエロバクター目 Thermoanaerobacterales
			ナトロアナエロビウス目 Natranaerobiales
		エリシペロスリックス綱 Erysipelotrichia	エリシペロスリックス目 Erysipelotrichales
		テルモリトバクター綱 Thermolithobacteria	テルモリトバクター目 Thermolithobacterales
		ネガティヴィクテス綱 Negativicutes	セレノモナス目 Selenomonadales
	マイコプラズマ門[2] Mycoplasmatota	モリクテス綱 Mollicutes	マイコプラズマ目 Mycoplasmatales
			エントモプラズマ目 Entomoplasmatales
			アコレプラズマ目 Acholeplasmatales
			アナエロプラズマ目 Anaeroplasmatales
			ハロプラズマ目 Haloplasmatales
	放線菌門 Actinomycetota 放線菌門 Actinomycetota	放線菌綱 Actinomycetes	アクチノミセス目 Actinomycetales
			Acidothermales目 Acidothermales
			アクチノポリスポラ目 Actinopolysporales
			ビフィドバクテリウム目 Bifidobacteriales
			カテヌリスポラ目 Catenulisporales
			コリネバクテリウム目 Corynebacteriales
			フランキア目 Frankiales
			Geodermatophilales目 Geodermatophilales
			グリコミセス目 Glycomycetales
			ジアンゲラ目 Jiangellales
			キネオスポリア目 Kineosporiales
			ミクロコックス目 Micrococcales
			ミクロモノスポラ目 Micromonosporales
			Nakamurellales目 Nakamurellales
			プロピオニバクテリウム目 Propionibacteriales
			シュードノカルディア目 Pseudonocardiales
			ストレプトミセス目 Streptomycetales
			ストレプトスポランギウム目 Streptosporangiales
		アシドミクロビウム綱 Acidimicrobiia	アシドミクロビウム目 Acidimicrobiales
		コリオバクター綱 Coriobacteriia	コリオバクター目 Coriobacteriales
		コリオバクター綱 Coriobacteriia	Eggerthellales目 Eggerthellales
		ニトリリルプトル綱 Nitriliruptoria	ニトリリルプトル目 Nitriliruptorales
			ユーゼバイア目 Euzebyales
			Egibacterales目 Egibacterales
			Egicoccales目 Egicoccales
		ルブロバクター綱 Rubrobacteria	ルブロバクター目 Rubrobacterales
		テルモレオフィルム綱 Thermoleophilia	テルモレオフィルム目 Thermoleophilales
			ソリルブロバクター目 Solirubrobacterales
			ガイエラ目 Gaiellales
	シアノバクテリア門 Cyanobacteriota	シアノバクテリア藻綱 Cyanophyceae	グロエオバクター目 Gloeobacterales
			グロエオマルガリータ目 Gloeomargaritales
			シネココックス目 Synechococcales
			ユレモ目 Oscillatoriales
			スピルリナ目 Spirulinales
			クロオコックス目 Chroococcales
			プレウロカプサ目 Pleurocapsales
			クロオコッキディオプシス目 Chroococcidiopsidales
			ネンジュモ目 Nostocales
		ウァンピロウィブリオ藻綱[3] Vampirovibrionophyceae	Caenarcanales目 Caenarcanales
			Gastranaerophilales目 Gastranaerophilales
			Obscuribacteriales目 Obscuribacteriales
			ウァンピロウィブリオ目 Vampirovibrionales
	クロロフレクスス門 Chloroflexota	クロロフレクスス綱 Chloroflexia	クロロフレクスス目 Chloroflexales
		クロロフレクスス綱 Chloroflexia	ヘルペトシフォン目 Herpetosiphonales
		アナエロリネア綱 Anaerolineae	アナエロリネア目 Anaerolineales
		カルディリネア綱 Caldilineae	カルディリネア目 Caldilineales
		テルモミクロビウム綱 Thermomicrobia	テルモミクロビウム目 Thermomicrobiales
		テルモミクロビウム綱 Thermomicrobia	スファエロバクター目 Sphaerobacterales
		クテドノバクター綱 Ktedonobacteria	クテドノバクター目 Ktedonobacterales
		クテドノバクター綱 Ktedonobacteria	テルモゲマティスポラ目 Thermogemmatisporales
デハロコッコイデス綱 Dehalococcoidia		デハロコッコイデス目 Dehalococcoidales
アルデンティカテナ綱 Ardenticatenia		アルデンティカテナ目 Ardenticatenales
テルモフレクスス綱 Thermoflexia		テルモフレクスス目 Thermoflexales
アルマティモナス門 Armatimonadota	アルマティモナス綱 Armatimonadia	アルマティモナス目 Armatimonadales
	クトノモナス綱 Chthonomonadetes	クトノモナス目 Chthonomonadales
	フィンブリイモナス綱 Fimbriimonadia	フィンブリイモナス目 Fimbriimonadales

バシラス界(Kingdom Bacillati)

グラム陽性菌を中心とするグループです。外膜を持たず、厚いペプチドグリカン層に特徴づけられます(例外有り)。

最近の系統解析によると、単系統群である可能性が高いです。但し含まれる門は分類体系により異なる場合があります。

姉妹群ははっきりしていません(一説によればシュードモナス界とも)。

陸地を中心に進化したことから、テッラバクテリア(Terrabacteria)とも呼ばれます。

バシラス門や放線菌門、シアノバクテリア門が有名です。当サイトでは暫定的に6門を認めます。

6つの門の間の関係ははっきりしていません(バシラス門とマイコプラズマ門は特に近縁なようです)。

バシラス門(Phylum Bacillota) = フィルミクテス門(Phylum Firmicutes)
マイコプラズマ門(Phylum Mycoplasmatota) = テネリクテス門(Phylum Tenericutes)
放線菌門(Phylum Actinomycetota)
シアノバクテリア門(Phylum Cyanobacteriota)
クロロフレクスス門(Phylum Chloroflexota)
アルマティモナス門(Phylum Armatimonadota)

かつてポジバクテリア亜界(Subkingdom Posibacteria)と呼ばれたグループに近いですが、含まれる生物は一部異なります。

バシラス門(Phylum Bacillota)

グラム陽性細菌門とも。放線菌門と並ぶ典型的なグラム陽性細菌で、暫定的に5綱9目を含みます。

以前はフィルミクテス門(Phylum Firmicutes)と呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、バシラス門(Phylum Bacillota)と改名されました。

フィルミクテス(Firmicutes)とはラテン語で強固な皮膚という意味で、グラム陽性菌の厚いペプチドグリカン層に由来しています。

乳酸菌や枯草菌(納豆菌など)、炭疽菌、ブドウ球菌、ボツリヌス菌など有名な細菌を多く含みます。

バシラス綱(Class Bacilli)
- バシラス目(Order Bacillales) - 枯草菌(納豆菌など)、炭疽菌、セレウス菌、ブドウ球菌(黄色ブドウ球菌など)
- ラクトバシラス目(Order Lactobacillales) - 乳酸菌の大半、レンサ球菌(ミュータンス菌、肺炎球菌など)
クロストリディウム綱(Class Clostridia)
- クロストリディウム目(Order Clostridiales) - ウェルシュ菌、破傷風菌、ボツリヌス菌、ヘリオバクテリア
- ハロアナエロビウム目(Order Halanaerobiales)
- テルモアナエロバクター目(Order Thermoanaerobacterales)
- ナトロアナエロビウス目(Order Natranaerobiales)
エリシペロスリックス綱(Class Erysipelotrichia)
- エリシペロスリックス目(Order Erysipelotrichales)
テルモリトバクター綱(Class Thermolithobacteria)
- テルモリトバクター目(Order Thermolithobacterales)
ネガティヴィクテス綱(Class Negativicutes)
- セレノモナス目(Order Selenomonadales)

マイコプラズマ門(Phylum Mycoplasmatota)

細胞壁を欠いた細菌のグループで、モリクテス綱(Mollicutes)1綱のみを含みます。暫定的に5目を含みます。

以前はテネリクテス門(Phylum Tenericutes)と呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、マイコプラズマ門(Phylum Mycoplasmatota)と改名されました。

テネリクテス(Tenericutes)やモリクテス(Mollicutes)はいずれもラテン語で柔らかい皮膚という意味で、細胞壁(ペプチドグリカン層)を欠き細胞膜が露出した柔らかい細胞に由来しています。

細胞壁を欠くためグラム陰性ですが、外膜を持たずバシラス門に近縁であるためバシラス界に含めています(バシラス門モリクテス綱とする分類もあります)。

細胞サイズが小さく、他の真核生物細胞に寄生することに特化している種が多いです(自由生活型の種もいます)。マイコプラズマやファイトプラズマが有名です。

モリクテス綱(Class Mollicutes)
- マイコプラズマ目(Order Mycoplasmatales)
- エントモプラズマ目(Order Entomoplasmatales)
- アコレプラズマ目(Order Acholeplasmatales) - ファイトプラズマ
- アナエロプラズマ目(Order Anaeroplasmatales)
- ハロプラズマ目(Order Haloplasmatales)

放線菌門(Phylum Actinomycetota)

バシラス門と並ぶ典型的なグラム陽性細菌で、暫定的に6綱29目を含む大きめのグループです。バシラス門と比較するとDNAのGC含量が高い特徴があります。

以前はActinobacteriaと呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、Actinomycetotaと改名されました（和名はそのままです）。

菌糸を放射状に伸ばすものが多いためこの名があります。「Actino～」とはギリシャ語で放射(ακτίς)という意味です。

ビフィズス菌、結核菌、らい菌、ジフテリア菌、アクネ菌、ストレプトマイシン生産菌などが有名です。

放線菌綱(Class Actinomycetes)
- アクチノミセス目(Order Actinomycetales)
- ビフィドバクテリウム目(Order Bifidobacteriales) - ビフィズス菌
- コリネバクテリウム目(Order Corynebacteriales) - 結核菌、らい菌、ジフテリア菌
- プロピオニバクテリウム目(Order Propionibacteriales) - アクネ菌
- ストレプトミセス目(Order Streptomycetales) - ストレプトマイシン生産菌
- (...etc)
アシドミクロビウム綱(Class Acidimicrobiia)
- アシドミクロビウム目(Order Acidimicrobiales)
コリオバクター綱(Class Coriobacteriia)
- コリオバクター目(Order Coriobacteriales)
- Eggerthellales目(Order Eggerthellales)
ニトリリルプトル綱(Class Nitriliruptoria)
- ニトリリルプトル目(Order Nitriliruptorales)
- ユーゼバイア目(Order Euzebyales)
- (...etc)
ルブロバクター綱(Class Rubrobacteria)
- ルブロバクター目(Order Rubrobacterales)
テルモレオフィルム綱(Class Thermoleophilia)
- テルモレオフィルム目(Order Thermoleophilales)
- ソリルブロバクター目(Order Solirubrobacterales)
- ガイエラ目(Order Gaiellales)

シアノバクテリア門(Phylum Cyanobacteriota)

藍色細菌門。シアノバクテリア、メライナバクテリアの仲間です。暫定的に2綱を含みます。

以前はCyanobacteriaと呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、Cyanobacteriotaと改名されました。これに伴い和名をシアノバクテリウム門とする場合もあります。

シアノバクテリア藻綱(Class Cyanophyceae)

シアノバクテリアの仲間です。暫定的に9目を含みます。酸素発生型光合成を行います。藍藻(blue-green algae)とも呼びます。

藍藻綱。クロロフィルとフィコビリンタンパク質を持ち、青緑色をしたものが多いです。植物のようですが、植物ではありません。

20数億年前から地球大気の酸素濃度が大幅に増加した「大酸化事変」(Great Oxidation Event)を引き起こしたグループとして知られています。

植物(アーケプラスチダ)の細胞小器官である葉緑体(色素体)はシアノバクテリア由来であると推測されています。

シアノバクテリア藻綱の目の分類は例えば以下のような例があります([Komárek et al. (2014)]を参考、あくまで暫定的です)。

グロエオバクター目(Order Gloeobacterales)
グロエオマルガリータ目(Order Gloeomargaritales)
シネココックス目(Order Synechococcales)
ユレモ目(Order Oscillatoriales) - ユレモ、スピルリナ(アルスロスピラ)
スピルリナ目(Order Spirulinales)
クロオコックス目(Order Chroococcales) - クロオコックス、スイゼンジノリ
プレウロカプサ目(Order Pleurocapsales)
クロオコッキディオプシス目(Order Chroococcidiopsidales)
ネンジュモ目(Order Nostocales) - ネンジュモ、アナベナ、イシクラゲ、アシツキ、ハッサイ

ウァンピロウィブリオ藻綱(Class Vampirovibrionophyceae)

メライナバクテリアの仲間です。暫定的に4目を含みます。光合成は行いません。

メライナバクテリア綱(Class Melainabacteria)とも呼ばれていますが、2023年に国際藻類・菌類・植物命名規約(ICN)によって、ウァンピロウィブリオ藻綱(Class Vampirovibrionophyceae)の名が提唱されています。

シアノバクテリア藻綱の姉妹群と推測されています。メライナバクテリア門と分類する場合もあります。

Caenarcanales目(Order Caenarcanales)
Gastranaerophilales目(Order Gastranaerophilales)
Obscuribacteriales目(Order Obscuribacteriales)
ウァンピロウィブリオ目(Order Vampirovibrionales)

クロロフレクスス門(Phylum Chloroflexota)

酸素非発生型の光合成を行う緑色非硫黄細菌(緑色滑走細菌)を始めとするグループで、暫定的に8綱11目を含みます。

以前はChloroflexiと呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、Chloroflexotaと改名されました（和名はそのままです）。

グラム陰性菌が多いですが、グラム陽性菌も約1/3あり、外膜を持たずペプチドグリカン層も変わった組成になっています。

最近の系統解析ではグラム陽性菌に近縁とする説が出ており、当サイトではバシラス界に含めています。

クロロフレクスス綱(Class Chloroflexia)
- クロロフレクスス目(Order Chloroflexales) - 緑色非硫黄細菌(緑色滑走細菌)
- ヘルペトシフォン目(Order Herpetosiphonales)
アナエロリネア綱(Class Anaerolineae)
- アナエロリネア目(Order Anaerolineales)
カルディリネア綱(Class Caldilineae)
- カルディリネア目(Order Caldilineales)
テルモミクロビウム綱(Class Thermomicrobia)
- テルモミクロビウム目(Order Thermomicrobiales)
- スファエロバクター目(Order Sphaerobacterales)
クテドノバクター綱(Class Ktedonobacteria)
- クテドノバクター目(Order Ktedonobacterales)
- テルモゲマティスポラ目(Order Thermogemmatisporales)
デハロコッコイデス綱(Class Dehalococcoidia)
- デハロコッコイデス目(Order Dehalococcoidales)
アルデンティカテナ綱(Class Ardenticatenia)
- アルデンティカテナ目(Order Ardenticatenales)
テルモフレクスス綱(Class Thermoflexia)
- テルモフレクスス目(Order Thermoflexales)

アルマティモナス門(Phylum Armatimonadota)

アルマティモナスの仲間で、暫定的に3綱3目を含みます。最近(2011年)提唱された新しい門です。

以前はArmatimonadetesと呼ばれていましたが、2021年に国際原核生物命名規約(ICNP)によって、Armatimonadotaと改名されました（和名はそのままです）。

グラム陰性菌ですが、系統解析ではグラム陽性菌に近縁とする結果もあり[A new view of the tree of life - Nature Microbiology]、暫定的にバシラス界に含めています(将来的には変更の可能性もあります)。

アルマティモナス綱(Class Armatimonadia)
- アルマティモナス目(Order Armatimonadales)
クトノモナス綱(Class Chthonomonadetes)
- クトノモナス目(Order Chthonomonadales)
フィンブリイモナス綱(Class Fimbriimonadia)
- フィンブリイモナス目(Order Fimbriimonadales)

目レベルの分類(Orders)